启动前清理氟塑料磁力泵周边影响安全的杂物，同时向泵腔内灌注液体，检查管道上所有阀门要开关正确。在长期停机或磁力泵检修后再次开机时，拆下电机的风扇罩并手动盘车,检查氟塑料磁力泵转动是否灵活，在确认没有问题后装好风扇罩。打开泵的进口阀，关闭泵的出口阀。启动泵时检查泵的声音及振动情况。在确认没有异常的情况下打开磁力泵的出口阀。
运行中注意事项：注意吸入端过滤器的前后压力差，压力差增大时，表示过滤器上有异物堵塞，要停止泵运行，以便清洗过滤器。排出量、排出压力是否符合规定值；有无异常声音及振动，若发生异常声音或振动，说明有气蚀或轴承过度磨损。